Neuroprotéomique et biomarqueurs

Le groupe « Neuroprotéomique et biomarqueurs » a pour objectif de développer et d’exploiter les derniers développements technologiques en spectrométrie de masse et immunodosages ultra sensibles pour la découverte, la validation et l’utilisation de biomarqueurs d’intérêt clinique (protéines, PTMs, ARN, ADN, métabolites) dans le cadre des maladies neurodégénératives.

Notre groupe est composé de 4 ingénieurs de développement (Dr. J. Vialaret, E. Attina, L. Fichter et L. Tiers), 2 techniciennes hospitalières (J. Kindermanns, N. Ginestet), 7 chercheurs (Pr. S. Lehmann, Pr. C. Hirtz, Dr. C. Delaby, Dr. X. Ayrignac, Dr. E. Moulis, Pr. P Labauge et Pr. D. Deville de Périère) et 5 PhD (P. Mohaupt, S. Coppens, ML. Pons, A. Amalric, S. Muccio).

Ces recherches sont soutenues par une forte activité de développement méthodologique principalement dans le domaine du préfractionnement, du préanalytique, des approches innovantes de spectrométrie de masse ainsi qu’une expertise reconnue dans le domaine des biomarqueurs d’intérêts clinique.

Pour atteindre nos objectifs, plusieurs approches technologiques tournées vers l’utilisation de prélèvements cliniques et un haut débit d’analyses sont disponibles (Conception et mise en œuvre de méthode de spectrométrie de masse quantitative et qualitative, identification de protéines dans des matrices biologiques, immunodosages ultra sensibles et multiplexes). Nous sommes équipés de systèmes de spectrométrie de masse de dernière génération de type LC-MS/MS (Q-TOF Impact 2 Bruker Daltonics et 3xTQ 8060 Shimadzu), un Maldi TOF (Axima Shimadzu), un robot de préparation haut débit des échantillons biologique (Bravo Assay Map Agilent) ainsi que de systèmes d’immunodosages ultra sensibles et multiplexes (SIMOA Quanterix HDX et Quickplex 120 MesoScale Discovery).

Faits marquants

- 2011 - Premier spectromètre de masse triple quadripôle Agilent 6490

- 2012 - Contrat de collaboration avec la société Agilent Technologies (Développement MS)

- 2014 - Contrat de collaboration avec la société Bruker Technologies (Développement MS)

- 2018 - Membre du centre d’Innovation Européen de la Société Shimadzu (Développement MS)

- 2019 - Collaboration avec K. Tanaka (Prix Nobel Chimie 2002, Shimadzu)

Publications marquantes 2011-2020

1- Lehmann S, Poinot P, Tiers L, Junot C, Becher F, Hirtz C. (2011) From "Clinical Proteomics" to "Clinical Chemistry Proteomics": considerations using quantitative mass-spectrometry as a model approach. Clin Chem Lab Med. Oct 8;50(2):235-42. (IF : 3.1)

2- Barthelemy N, Lehmann S, Hirtz C, Gabelle A, Sergeant N, Fenaille F, Vialaret J, Schraen S, Bros P, Tiers L, Delaby C, Junot C, Touchon J, Buee L, Becher F. Detection and Quantification of the Tau Protein and Its Isoforms in the CSF of Alzheimer's Disease Patients Using Mass Spectrometry. Alzheimer's & Dementia.10 (no. 4 sup): p. 147.(IF : 14.5)

3- Hirtz C, Vialaret J, Gabelle A, Nowak N, Dauvilliers Y and Lehmann S. From radioimmunoassay to mass spectrometry: a new method to quantify orexin-A (hypocretin-1) in cerebrospinal fluid. Scientific Reports. 2016 May 11;6: 25162. (IF:5.9)

4- Vialaret J, Wessels H, van Gool AJ, Lehmann S, Gabelle A, Wood J, Bern M, Paape R, Suckau D, Kruppa G and C Hirtz. Towards a routine application of Top-Down approaches for Label-Free discovery Workflows. Journal of Proteomics. 2018. Mar 20;175:12-26. (IF : 3.88).

5-Paterson RW, Gabelle A, Lucey BP, Barthélemy NR, Leckey CA, Hirtz C, Lehmann S, Sato C, Patterson BW, West T, Yarasheski K, Rohrer JD, Wildburger NC, Schott JM, Karch CM, Wray S, Miller TM, Elbert DL, Zetterberg H, Fox NC, Bateman RJ. SILK studies - capturing the turnover of proteins linked to neurodegenerative diseases. Nat Rev Neurol. 2019 Jul;15(7):419-427 (IF : 21.15)